12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1724 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1724  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  246  9e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.553906  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5987  hypothetical protein  80.47 
 
 
128 aa  176  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.41743  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3041  hypothetical protein  54.4 
 
 
128 aa  142  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154863  normal  0.0395279 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33930  hypothetical protein  63.2 
 
 
131 aa  140  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0392709  normal  0.15208 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3417  hypothetical protein  63.2 
 
 
140 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138798  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2886  hypothetical protein  61.6 
 
 
147 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0803813  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26680  hypothetical protein  59.82 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.286452 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1742  hypothetical protein  54.69 
 
 
131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50890  hypothetical protein  66.36 
 
 
110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.455755  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1060  hypothetical protein  54.78 
 
 
129 aa  103  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1828  hypothetical protein  54.92 
 
 
130 aa  93.6  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0824179  normal  0.0353192 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1651  cell wall hydrolase/autolysin  29.66 
 
 
1504 aa  45.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>