17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2208 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2208  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1697  hypothetical protein  70.54 
 
 		 136 aa  177  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.193852 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0655  hypothetical protein  66.14 
 
 		 132 aa  170  5.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.223219  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0563  hypothetical protein  67.72 
 
 		 131 aa  166  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.9465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1918  hypothetical protein  62.5 
 
 		 135 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3597  hypothetical protein  69.77 
 
 		 136 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7106  hypothetical protein  60.9 
 
 		 128 aa  153  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4468  hypothetical protein  42.86 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3987  hypothetical protein  42.53 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.114645  normal  0.967393 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4356  hypothetical protein  42.53 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0450  hypothetical protein  41.38 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4819  hypothetical protein  45.57 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3017  hypothetical protein  43.42 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.501407  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0060  hypothetical protein  36.96 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0457605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5935  hypothetical protein  41.98 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0168304  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5240  hypothetical protein  38.27 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486549  hitchhiker  0.00714589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3740  hypothetical protein  32.89 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0695109 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>