20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0235 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0235  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3769  hypothetical protein  65.71 
 
 		 94 aa  87  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.484717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2616  hypothetical protein  64.29 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.873704 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3718  hypothetical protein  65.15 
 
 		 81 aa  85.9  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0446271 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2811  hypothetical protein  65.71 
 
 		 87 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2588  hypothetical protein  65.71 
 
 		 87 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1168  hypothetical protein  67.8 
 
 		 75 aa  82  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4320  hypothetical protein  61.29 
 
 		 63 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7269  hypothetical protein  63.93 
 
 		 85 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4315  hypothetical protein  55.88 
 
 		 77 aa  73.6  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165808  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6018  hypothetical protein  57.14 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1041  hypothetical protein  52.24 
 
 		 72 aa  67.4  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.187119 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0792  hypothetical protein  56.9 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4601  hypothetical protein  45.59 
 
 		 69 aa  60.8  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0058  hypothetical protein  53.45 
 
 		 70 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4815  hypothetical protein  51.72 
 
 		 71 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.471374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4521  hypothetical protein  51.72 
 
 		 71 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4434  hypothetical protein  51.72 
 
 		 71 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9013  Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase)  68.29 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167373  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9059  Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase)  68.29 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0953777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>