12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1178 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1178  hypothetical protein  100 
 
 		 53 aa  103  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2863  hypothetical protein  76.6 
 
 		 59 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3277  hypothetical protein  69.23 
 
 		 51 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.878206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2580  hypothetical protein  75 
 
 		 51 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3136  hypothetical protein  81.4 
 
 		 51 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2391  hypothetical protein  69.39 
 
 		 54 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.595265  hitchhiker  0.00196894 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000079  hypothetical protein  49.06 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.231186  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1366  hypothetical protein  82.61 
 
 		 53 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0687326  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1408  hypothetical protein  54.35 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05692  hypothetical protein  48.15 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0292  hypothetical protein  65.96 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000163282  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0304  hypothetical protein  65.96 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000261079  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>