35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2241 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2241  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  171  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0077  hypothetical protein  73.49 
 
 		 84 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.145209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0083  hypothetical protein  73.49 
 
 		 85 aa  124  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.394858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0679  hypothetical protein  37.25 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3860  hypothetical protein  40.82 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03981  predicted nucleic-acid-binding protein containing an-ribbon domain  40 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.978441  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0301  hypothetical protein  31.75 
 
 		 64 aa  43.5  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0900  hypothetical protein  35.09 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0888  hypothetical protein  35.09 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0864  hypothetical protein  35.09 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0594  hypothetical protein  35.29 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.203773 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3116  hypothetical protein  35.09 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0886  hypothetical protein  36 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2183  hypothetical protein  32.81 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000451825  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3767  hypothetical protein  40.82 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103883  hitchhiker  0.00329253 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3392  hypothetical protein  36 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3280  hypothetical protein  36 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0742  hypothetical protein  36 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3177  hypothetical protein  38.78 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4659  hypothetical protein  34.69 
 
 		 66 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329375  normal  0.021079 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3724  hypothetical protein  34.69 
 
 		 66 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000786305  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0363  conserved hypothetical protein  34.69 
 
 		 66 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869191  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3631  hypothetical protein  34.69 
 
 		 66 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000471494  hitchhiker  0.000413394 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03152  hypothetical protein  34.69 
 
 		 66 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000462043  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0363  hypothetical protein  34.69 
 
 		 66 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.049912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3819  hypothetical protein  34.69 
 
 		 66 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000754125  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3546  hypothetical protein  34.69 
 
 		 66 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117809  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3283  hypothetical protein  36.73 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0111  hypothetical protein  32.08 
 
 		 68 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242555  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4559  hypothetical protein  32.73 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0405858  normal  0.361912 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3475  hypothetical protein  33.33 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0267  hypothetical protein  28.07 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.412857  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3686  hypothetical protein  28.07 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.88375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3929  hypothetical protein  28.07 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0358004  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00067  hypothetical protein  34.38 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>