11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0554 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0554  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  234  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0544  hypothetical protein  63.16 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.877746  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0509  hypothetical protein  63.16 
 
 		 114 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0562  hypothetical protein  63.16 
 
 		 114 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.543856 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0685  hypothetical protein  56.14 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4467  hypothetical protein  55.75 
 
 		 117 aa  124  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06660  hypothetical protein  55.75 
 
 		 111 aa  117  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.205122  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5024  hypothetical protein  52.99 
 
 		 119 aa  114  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.577738  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3862  hypothetical protein  53.51 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1040  hypothetical protein  48.67 
 
 		 114 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.665331  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11330  hypothetical protein  46.9 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00109157  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>