12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1739 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1739  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0074  hypothetical protein  40.91 
 
 
66 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0072  hypothetical protein  40.91 
 
 
66 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2520  hypothetical protein  42.31 
 
 
68 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2832  hypothetical protein  33.33 
 
 
66 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127679  normal  0.395635 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1444  hypothetical protein  36.92 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.144601 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1776  hypothetical protein  33.33 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.773877  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4296  hypothetical protein  30.51 
 
 
61 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3809  hypothetical protein  36.36 
 
 
66 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3860  hypothetical protein  36.36 
 
 
66 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2525  hypothetical protein  36.36 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3745  hypothetical protein  22.73 
 
 
73 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.364791 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>