22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4810 on replicon NC_008761
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008761  Pnap_4810  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  172  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0802082  hitchhiker  0.00240732 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4381  hypothetical protein  75.86 
 
 		 84 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.735891 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0631  hypothetical protein  69.05 
 
 		 82 aa  118  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0176  hypothetical protein  51.22 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000154449  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1870  hypothetical protein  46.34 
 
 		 85 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000823152  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0234  hypothetical protein  47.56 
 
 		 84 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2566  hypothetical protein  48.78 
 
 		 85 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021382  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2786  hypothetical protein  46.43 
 
 		 91 aa  73.6  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.758487  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2212  hypothetical protein  42.17 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1936  hypothetical protein  40.96 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.526539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3462  hypothetical protein  42.17 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.438272 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1827  hypothetical protein  40 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2349  hypothetical protein  32.53 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000863109  normal  0.0220704 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5414  hypothetical protein  38.37 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2294  hypothetical protein  30.77 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00328626  hitchhiker  0.00199724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6355  hypothetical protein  36.59 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7138  hypothetical protein  35.8 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7049  hypothetical protein  40.23 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0979561 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4320  hypothetical protein  39.13 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0032  hypothetical protein  42.53 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2046  hypothetical protein  28.92 
 
 		 87 aa  47  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000343209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4119  hypothetical protein  39.08 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>