13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4234 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4234  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  356  7e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0404  hypothetical protein  54.4 
 
 		 184 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04060  hypothetical protein  59.12 
 
 		 184 aa  170  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2116  hypothetical protein  59.12 
 
 		 184 aa  169  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41790  hypothetical protein  29.21 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2537  hypothetical protein  30.29 
 
 		 140 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.332563  hitchhiker  0.00562659 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3546  hypothetical protein  28.65 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68791  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3007  hypothetical protein  37.5 
 
 		 338 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.684884  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2161  hypothetical protein  39.68 
 
 		 286 aa  46.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0262999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0701  hypothetical protein  42.86 
 
 		 797 aa  45.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.176551  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1578  hypothetical protein  35.85 
 
 		 282 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000645416  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5389  hypothetical protein  41.07 
 
 		 348 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61940  hypothetical protein  39.29 
 
 		 348 aa  41.2  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.149429 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>