9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3368 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3368  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  373  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1440  putative lipoprotein  67.21 
 
 		 183 aa  266  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16560  putative lipoprotein  65.57 
 
 		 183 aa  258  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1062  putative lipoprotein  54.59 
 
 		 184 aa  202  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39370  hypothetical protein  55.43 
 
 		 180 aa  194  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4119  lipoprotein  51.61 
 
 		 182 aa  190  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1103  lipoprotein  51.61 
 
 		 182 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1498  putative lipoprotein  51.08 
 
 		 182 aa  187  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00314767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4224  hypothetical protein  50.54 
 
 		 182 aa  187  9e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98466  normal  1 
 
 
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