14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2494 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2494  protein of unknown function DUF1552  100 
 
 		 439 aa  912    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0032  protein of unknown function DUF1552  34.14 
 
 		 457 aa  246  4.9999999999999997e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3316  protein of unknown function DUF1552  35.49 
 
 		 431 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.330575  normal  0.0574883 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0286  protein of unknown function DUF1552  29.8 
 
 		 456 aa  162  8.000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1492  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  29.78 
 
 		 421 aa  158  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0128  protein of unknown function DUF1552  28.7 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5968  protein of unknown function DUF1552  27.08 
 
 		 468 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0946  protein of unknown function DUF1552  26.1 
 
 		 427 aa  116  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.795555  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3240  protein of unknown function DUF1552  27.19 
 
 		 433 aa  100  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0506735  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1568  hypothetical protein  25.36 
 
 		 455 aa  99.4  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0569  protein of unknown function DUF1552  25 
 
 		 452 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2374  hypothetical protein  24.28 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.060586 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1263  putative transcriptional regulator, RpiR family  23.03 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0248701 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1184  lysyl-tRNA synthetase, class-2  20.38 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.163647 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>