9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3131 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3131  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  156  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1793  hypothetical protein  43.75 
 
 		 80 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.286294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1953  hypothetical protein  45.45 
 
 		 80 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3342  hypothetical protein  45.45 
 
 		 80 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3902  hypothetical protein  43.06 
 
 		 78 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.792741  normal  0.822536 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4593  hypothetical protein  38.89 
 
 		 78 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1295  hypothetical protein  38.89 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4123  hypothetical protein  38.89 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1528  hypothetical protein  32.91 
 
 		 86 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  normal  0.202496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>