15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2363 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2363  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  234  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.880007  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2077  conserved hypothetical protein  43.75 
 
 
110 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0041669  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2070  hypothetical protein  43.75 
 
 
110 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3438  hypothetical protein  35.05 
 
 
158 aa  53.5  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  hitchhiker  0.000486984 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2935  hypothetical protein  47.92 
 
 
113 aa  51.2  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00149974  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1323  hypothetical protein  33.67 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.61887e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1434  hypothetical protein  33.67 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00170755  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02307  conserved hypothetical protein  41.6 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000254731  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2542  hypothetical protein  41.6 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000390967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1271  hypothetical protein  41.6 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000174632  hitchhiker  0.00144194 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02268  hypothetical protein  41.6 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000251341  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2742  hypothetical protein  33.67 
 
 
115 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000210671  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0804  hypothetical protein  38.1 
 
 
110 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.915166  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2695  hypothetical protein  38.4 
 
 
113 aa  42.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000211518  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2772  hypothetical protein  38.4 
 
 
113 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000074375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>