26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2121 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2121  DNA polymerase III subunit theta  100 
 
 		 76 aa  157  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1837  DNA polymerase III subunit theta  96.05 
 
 		 76 aa  152  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.97705  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1941  DNA polymerase III subunit theta  85.53 
 
 		 76 aa  132  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286111 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2117  DNA polymerase III subunit theta  71.05 
 
 		 76 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1345  DNA polymerase III subunit theta  71.05 
 
 		 76 aa  114  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.385833 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01801  hypothetical protein  71.05 
 
 		 76 aa  114  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2577  DNA polymerase III subunit theta  71.05 
 
 		 76 aa  114  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.477917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1373  DNA polymerase III subunit theta  69.74 
 
 		 76 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000169619 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2030  DNA polymerase III subunit theta  69.74 
 
 		 76 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.531552  normal  0.522468 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2090  DNA polymerase III subunit theta  69.74 
 
 		 76 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2035  DNA polymerase III subunit theta  69.74 
 
 		 76 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.512691  normal  0.0941775 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01813  DNA polymerase III, theta subunit  71.05 
 
 		 76 aa  114  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1790  DNA polymerase III subunit theta  71.05 
 
 		 76 aa  114  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712189  normal  0.095364 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2071  DNA polymerase III subunit theta  71.05 
 
 		 76 aa  114  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1933  DNA polymerase III subunit theta  71.05 
 
 		 76 aa  114  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2413  DNA polymerase III subunit theta  69.74 
 
 		 76 aa  114  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1800  DNA polymerase II beta subunit  71.05 
 
 		 76 aa  114  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.614073  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1248  DNA polymerase III subunit theta  69.74 
 
 		 76 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2239  DNA polymerase II beta subunit  71.05 
 
 		 76 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2439  DNA polymerase III subunit theta  71.05 
 
 		 76 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1625  DNA polymerase III subunit theta  71.05 
 
 		 76 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2343  DNA polymerase III subunit theta  71.05 
 
 		 76 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.763691  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2126  DNA polymerase II beta subunit  65.79 
 
 		 76 aa  106  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2040  DNA polymerase II beta subunit  68.66 
 
 		 86 aa  87  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.079168  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2258  DNA polymerase III subunit theta  68.09 
 
 		 51 aa  67.8  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000273189  unclonable  0.00000264119 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3213  hypothetical protein  37.7 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.381442  normal  0.0167103 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>