19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2149 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2149  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  347  4e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1860  hypothetical protein  97.02 
 
 
168 aa  340  8e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2186  hypothetical protein  63.1 
 
 
189 aa  224  4e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0146743  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4400  hypothetical protein  32.76 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188798 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5470  hypothetical protein  30.17 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5360  hypothetical protein  27.88 
 
 
124 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.693226  normal  0.324746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5561  hypothetical protein  28.1 
 
 
128 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70590  hypothetical protein  29.57 
 
 
130 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5312  hypothetical protein  26.92 
 
 
124 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.828219  normal  0.0468247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6124  hypothetical protein  28.7 
 
 
130 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5221  hypothetical protein  25.96 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.568933  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5025  hypothetical protein  28.45 
 
 
125 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.665825 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0312  hypothetical protein  25.66 
 
 
132 aa  55.5  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1169  hypothetical protein  34.18 
 
 
118 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0161  hypothetical protein  26.53 
 
 
125 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.323889  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1325  hypothetical protein  28.7 
 
 
118 aa  51.2  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4733  hypothetical protein  23.85 
 
 
132 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.760088 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0712  hypothetical protein  36.21 
 
 
231 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.502118  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3248  hypothetical protein  26.25 
 
 
119 aa  40.4  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>