50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2936 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2936  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  181  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.85236e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2956  redox-active disulfide protein 2  36.36 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3598  redox-active disulfide protein 2  34.62 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.420898 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1877  redox-active disulfide protein 2  32.05 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2564  redox-active disulfide protein 2  35 
 
 
75 aa  47.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000509192  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0818  redox-active disulfide protein 2  39.34 
 
 
77 aa  47.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519826  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0698  redox-active disulfide protein 2  34.43 
 
 
80 aa  47.4  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.606371  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0691  redox-active disulfide protein 2  37.66 
 
 
77 aa  47.8  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.322744  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2073  redox-active disulfide protein 2  33.33 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0752  redox-active disulfide protein 2  31.17 
 
 
78 aa  47.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0355259 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1749  redox-active disulfide protein 2  37.88 
 
 
80 aa  47.4  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0327584  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2180  redox-active disulfide protein 2  36.36 
 
 
75 aa  47.4  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000368742  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1803  redox-active disulfide protein 2  34.85 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1322  redox-active disulfide protein 2  32.86 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0750  redox-active disulfide protein 2  37.7 
 
 
77 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1205  redox-active disulfide protein 2  35.06 
 
 
77 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0663  redox-active disulfide protein 2  38.03 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.164477  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0457  redox-active disulfide protein 2  34.43 
 
 
79 aa  46.2  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0155  hypothetical protein  35.06 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0815  hypothetical protein  32.84 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.371322  normal  0.817572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5315  redox-active disulfide protein 2  35 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.31849  normal  0.0964369 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0018  redox-active disulfide protein 2  33.77 
 
 
77 aa  45.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2567  redox-active disulfide protein 2  31.82 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4013  redox-active disulfide protein 2  34.38 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1028  redox-active disulfide protein 2  32.91 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0508  redox-active disulfide protein 2  32.81 
 
 
77 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1116  redox-active disulfide protein 2  33.33 
 
 
77 aa  45.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0518  redox-active disulfide protein 2  32.47 
 
 
75 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1710  hypothetical protein  32.91 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0068017  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0436  redox-active disulfide protein 2  33.33 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1705  redox-active disulfide protein 2  42 
 
 
94 aa  45.1  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.820671 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2641  redox-active disulfide protein 2  31.34 
 
 
81 aa  44.3  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1090  redox-active disulfide protein 2  34.33 
 
 
77 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1300  redox-active disulfide protein 2  34.21 
 
 
75 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0546  redox-active disulfide protein 2  31.34 
 
 
79 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058449  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0264  redox-active disulfide protein 2  35.14 
 
 
73 aa  43.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1484  redox-active disulfide protein 2  30.3 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.591966  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2778  redox-active disulfide protein 2  28.77 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1903  redox-active disulfide protein 2  31.82 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.76321  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1782  redox-active disulfide protein 2  33.33 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.889289  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0943  redox-active disulfide protein 2  29.41 
 
 
77 aa  41.6  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0856  redox-active disulfide protein 2  31.08 
 
 
75 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2554  redox-active disulfide protein 2  32.1 
 
 
80 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000309431  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0185  putative thioredoxin  30.77 
 
 
77 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1684  redox-active disulfide protein 2  32.79 
 
 
78 aa  41.6  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.465445  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3648  redox-active disulfide protein 2  35.62 
 
 
77 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0399  redox-active disulfide protein 2  28.99 
 
 
98 aa  41.2  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.11443  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4061  redox-active disulfide protein 2  32.31 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.564529  normal  0.892222 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1624  redox-active disulfide protein 2  26.47 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000124454  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0586  redox-active disulfide protein 2  28.36 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>