24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1434 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1434  adenylate kinase  100 
 
 
196 aa  396  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0910302 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1687  adenylate kinase  61.05 
 
 
198 aa  240  1e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.515273  normal  0.0373221 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1829  adenylate kinase  55.79 
 
 
198 aa  234  7e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0011881  normal  0.0929136 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0709  adenylate kinase  58.95 
 
 
198 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0378  adenylate kinase  51.05 
 
 
204 aa  210  9e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0113916  normal  0.834439 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1497  Adenylate kinase  46.01 
 
 
181 aa  138  6e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0105  adenylate kinase  42.01 
 
 
190 aa  132  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.640002  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0556  adenylate kinase  40.24 
 
 
190 aa  122  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.261515 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0115  adenylate kinase  38.89 
 
 
194 aa  119  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000149459  hitchhiker  0.0000475665 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2229  adenylate kinase  37.28 
 
 
190 aa  119  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.568748  normal  0.396144 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0466  adenylate kinase  38.46 
 
 
190 aa  116  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0403  adenylate kinase  41.5 
 
 
192 aa  110  9e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.230243 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1754  Adenylate kinase  37.42 
 
 
195 aa  107  9.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.137962  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0354  adenylate kinase  38.69 
 
 
192 aa  99.4  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0285  adenylate kinase  37.86 
 
 
192 aa  99.4  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0155043 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1130  adenylate kinase  37.78 
 
 
193 aa  98.6  5e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1628  adenylate kinase  37.14 
 
 
192 aa  98.6  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.378926  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0562  adenylate kinase  37.14 
 
 
192 aa  97.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.155535  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0588  adenylate kinase  36.17 
 
 
192 aa  95.9  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.145693  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2000  adenylate kinase-like protein  25.47 
 
 
185 aa  45.8  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000037727  normal  0.0984178 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1700  Shikimate kinase  28.79 
 
 
172 aa  43.1  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0559  adenylate kinase-like protein  25.95 
 
 
257 aa  42  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.018357  normal  0.739133 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2258  hypothetical protein  27.54 
 
 
193 aa  42  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00544842  hitchhiker  0.00842932 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3334  ABC transporter related  31.93 
 
 
637 aa  41.2  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.115349 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>