23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1622 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1622  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01943  hypothetical protein  45.99 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0504708  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1199  hypothetical protein  40 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1804  hypothetical protein  36.94 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389393  hitchhiker  0.0035838 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1690  hypothetical protein  32.81 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.278449  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003884  DNA repair ATPase  34.48 
 
 		 232 aa  148  9e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1323  hypothetical protein  34 
 
 		 257 aa  141  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2249  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01792  hypothetical protein  33.47 
 
 		 254 aa  140  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2488  hypothetical protein  33.2 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.216175  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2608  hypothetical protein  33.2 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0307419  decreased coverage  0.000510715 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1856  hypothetical protein  33.2 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0849639  decreased coverage  0.00000000166193 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2097  hypothetical protein  33.89 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.308927  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2495  hypothetical protein  32.79 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1499  hypothetical protein  32.2 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000480676  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1623  hypothetical protein  32.78 
 
 		 258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal  0.0571919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1730  hypothetical protein  31.97 
 
 		 259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0608955  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2650  hypothetical protein  30.86 
 
 		 259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1661  hypothetical protein  31.33 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.100464  unclonable  0.0000162352 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1586  hypothetical protein  31.33 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0274454  normal  0.0602505 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1536  hypothetical protein  31.12 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0198685  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2840  hypothetical protein  31.45 
 
 		 257 aa  129  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0776012  hitchhiker  0.00000164508 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1449  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000835814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>