11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0141 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0141  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  187  4e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0883  hypothetical protein  45.68 
 
 
79 aa  72  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.624686 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2328  protein of unknown function nitrogen fixation  57.69 
 
 
85 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.79284  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0887  hypothetical protein  55.74 
 
 
68 aa  67  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.407516 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0876  hypothetical protein  56.6 
 
 
86 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.140565  normal  0.635161 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0867  hypothetical protein  52.83 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.338727  normal  0.433648 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0885  hypothetical protein  51.79 
 
 
94 aa  62  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.398266 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0868  hypothetical protein  49.02 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.554422  normal  0.423593 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1446  hypothetical protein  40.32 
 
 
79 aa  52  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0193  hypothetical protein  33.33 
 
 
73 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2744  hypothetical protein  33.33 
 
 
73 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>