25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4047 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4047  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  661    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4046  hypothetical protein  37.5 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02559  putative transmembrane protein  27.63 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.149147  normal  0.0738057 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2788  hypothetical protein  25.79 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000160051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2213  hypothetical protein  25 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0822769  hitchhiker  2.3052800000000003e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2793  hypothetical protein  22.68 
 
 		 415 aa  67  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000251308  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3058  hypothetical protein  24.1 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0016341  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3035  hypothetical protein  24.19 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.384994  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0257  hypothetical protein  33.33 
 
 		 442 aa  63.2  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0683167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0259  hypothetical protein  33.33 
 
 		 442 aa  63.2  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.056093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0255  hypothetical protein  34.23 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00498316  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2839  hypothetical protein  25.78 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0837377  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3095  hypothetical protein  28.65 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.384409  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0260  hypothetical protein  32.43 
 
 		 443 aa  59.3  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2211  hypothetical protein  24.14 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000192323  unclonable  6.99886e-26 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2855  hypothetical protein  22.66 
 
 		 412 aa  55.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000208059  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2786  hypothetical protein  29.7 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000620206  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2018  hypothetical protein  22.45 
 
 		 411 aa  54.3  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0359073  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36250  hypothetical protein  28.95 
 
 		 294 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.221763  hitchhiker  0.00132381 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2010  hypothetical protein  23.55 
 
 		 412 aa  53.5  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0742406  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1194  hypothetical protein  26.34 
 
 		 382 aa  52.4  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2826  hypothetical protein  24.34 
 
 		 412 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000022412  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1196  hypothetical protein  23.44 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000988852  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS06033  hypothetical protein  31 
 
 		 186 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.978275  normal  0.420987 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5558  Sel1  40 
 
 		 56 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.575536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>