11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2879 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2879  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.940636 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2811  hypothetical protein  98.48 
 
 		 197 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104113  normal  0.922801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2903  hypothetical protein  95.43 
 
 		 197 aa  361  4e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.616546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2383  hypothetical protein  84.77 
 
 		 197 aa  344  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.931226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2294  hypothetical protein  52.69 
 
 		 208 aa  185  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2644  hypothetical protein  52.87 
 
 		 189 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0534389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07200  hypothetical protein  41.88 
 
 		 365 aa  94  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3677  hypothetical protein  38.66 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.676498 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3818  hypothetical protein  40.18 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.543496 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3091  hypothetical protein  39.29 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1742  hypothetical protein  36.56 
 
 		 1448 aa  41.2  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.416454 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>