15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0451 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0451  gibberellin regulated protein  100 
 
 
77 aa  159  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.831022  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12771  hypothetical protein  72.73 
 
 
45 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.02267  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12841  gibberellin regulated protein-like protein  72.73 
 
 
45 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.796824  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1213  gibberellin regulated protein-like  70.45 
 
 
45 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00513732  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1500  gibberellin regulated protein-like  72.73 
 
 
45 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0496653  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1347  hypothetical protein  31.94 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.744202  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1572  hypothetical protein  36.23 
 
 
73 aa  61.2  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.102993  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06871  hypothetical protein  51.28 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06481  hypothetical protein  55.88 
 
 
136 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15271  hypothetical protein  62.07 
 
 
30 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.852768  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0622  hypothetical protein  56.67 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06781  hypothetical protein  52.94 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1029  hypothetical protein  36.92 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18991  hypothetical protein  32.91 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1516  hypothetical protein  36.84 
 
 
85 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0470453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>