34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0417 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0417  high light inducible protein  100 
 
 
39 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11141  hypothetical protein  97.37 
 
 
41 aa  77.4  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.242488  hitchhiker  0.00189562 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0602  high light inducible protein  81.58 
 
 
41 aa  67.4  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.220057  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1718  high light inducible protein  81.58 
 
 
41 aa  67.4  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13551  hypothetical protein  81.58 
 
 
41 aa  67.4  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.168201 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13161  hypothetical protein  81.58 
 
 
41 aa  67.4  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.27545 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04361  hypothetical protein  81.58 
 
 
41 aa  67.4  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.354033  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0507  high light inducible protein  81.58 
 
 
41 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.320357  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0551  high light inducible protein  81.58 
 
 
41 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00877549  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14091  hypothetical protein  81.58 
 
 
41 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.135077  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12351  hypothetical protein  81.58 
 
 
41 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08871  high light inducible protein  76.32 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.799327  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07501  high light inducible protein  69.44 
 
 
84 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07481  high light inducible protein  69.44 
 
 
84 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.274779  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11661  hypothetical protein  68.42 
 
 
39 aa  58.9  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.120143 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0700  high light inducible protein-like  66.67 
 
 
84 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.15579  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1508  high light inducible protein-like  66.67 
 
 
42 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.945856  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08891  high light inducible protein  73.53 
 
 
42 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17461  high light inducible protein  73.53 
 
 
42 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.528632  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0686  high light inducible protein-like  67.5 
 
 
42 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13201  high light inducible protein  67.5 
 
 
42 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.387322  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13061  high light inducible protein  67.5 
 
 
42 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1230  high light inducible protein-like  65 
 
 
42 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1229  high light inducible protein-like  64.52 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04201  high light inducible protein  67.74 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13191  high light inducible protein  67.74 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.574144  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12661  hypothetical protein  56.25 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.17207  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13051  high light inducible protein  67.74 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1173  high light inducible protein-like  56.25 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.360443  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12601  high light inducible protein  56.25 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.408984  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17471  high light inducible protein  67.74 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.689877  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08901  high light inducible protein  67.74 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1509  high light inducible protein-like  64.52 
 
 
50 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12411  high light inducible protein  56.25 
 
 
84 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>