19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0344 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0344  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.220946  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10171  hypothetical protein  97.56 
 
 
205 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.341837  hitchhiker  0.00113204 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08991  hypothetical protein  51.81 
 
 
207 aa  212  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0478763  decreased coverage  0.000000303801 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14721  hypothetical protein  48.74 
 
 
207 aa  206  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0155051 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1142  hypothetical protein  45.37 
 
 
219 aa  202  3e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1332  hypothetical protein  45.32 
 
 
216 aa  201  8e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0882847 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09461  hypothetical protein  44.95 
 
 
208 aa  184  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09951  hypothetical protein  42.42 
 
 
208 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0372503  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0936  hypothetical protein  42.93 
 
 
208 aa  168  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.36601  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09971  hypothetical protein  42.78 
 
 
208 aa  165  5e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.657765  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0580  hypothetical protein  36.18 
 
 
212 aa  144  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.298274  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1879  hypothetical protein  36.82 
 
 
215 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0953  hypothetical protein  41 
 
 
214 aa  142  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.429984  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4605  hypothetical protein  38.55 
 
 
215 aa  141  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0109117  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1803  hypothetical protein  37.5 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1831  CGLD23 protein  36.96 
 
 
216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4208  hypothetical protein  36.56 
 
 
222 aa  138  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1673  hypothetical protein  38.42 
 
 
221 aa  136  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_87928  predicted protein  27.72 
 
 
281 aa  64.3  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.121292  normal  0.471917 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>