18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0242 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0242  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  259  1e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.504649  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09091  hypothetical protein  93.94 
 
 
132 aa  243  9e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204953 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04251  hypothetical protein  38.81 
 
 
85 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06661  hypothetical protein  28.46 
 
 
114 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.224874 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10511  hypothetical protein  28.57 
 
 
129 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0980  hypothetical protein  27.78 
 
 
129 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0476003  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10501  hypothetical protein  27.42 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20651  hypothetical protein  40.32 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.193558 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1760  hypothetical protein  37.31 
 
 
73 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04821  hypothetical protein  36.36 
 
 
73 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04841  hypothetical protein  34.25 
 
 
74 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0484083  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04531  hypothetical protein  34.25 
 
 
74 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0428  hypothetical protein  34.25 
 
 
74 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1864  cytochrome b6-f complex subunit PetP  35.38 
 
 
64 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1890  hypothetical protein  35.38 
 
 
64 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.123019  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04911  hypothetical protein  31.58 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06491  hypothetical protein  36.51 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.280485 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0807  hypothetical protein  28.57 
 
 
71 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0825595  hitchhiker  0.00735224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>