19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_13253 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_13253  predicted protein  100 
 
 
83 aa  173  6e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.890821  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0615  hypothetical protein  35.71 
 
 
104 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.65089  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0600  hypothetical protein  35.71 
 
 
104 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0901  hypothetical protein  35.71 
 
 
105 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17571  hypothetical protein  35.71 
 
 
105 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2530  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05601  hypothetical protein  35.71 
 
 
108 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.808927 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2572  hypothetical protein  38.75 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.264032  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2103  hypothetical protein  35.71 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0443  hypothetical protein  33.33 
 
 
107 aa  52.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.164399  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2065  hypothetical protein  33.33 
 
 
107 aa  51.6  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0566  hypothetical protein  35.71 
 
 
109 aa  52  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15161  hypothetical protein  34.52 
 
 
107 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13841  hypothetical protein  34.52 
 
 
108 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15301  hypothetical protein  34.52 
 
 
107 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1428  hypothetical protein  34.52 
 
 
107 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.567552  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0927  hypothetical protein  33.33 
 
 
107 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2487  hypothetical protein  32.14 
 
 
109 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14911  hypothetical protein  33.33 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>