16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_13028 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_13028  predicted protein  100 
 
 
197 aa  414  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.220703  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7517  predicted protein  46.11 
 
 
206 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.403297  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00580  expressed protein  35.57 
 
 
637 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.513861  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03731  SprT family metallopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12420)  40 
 
 
690 aa  104  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.896166  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1277  hypothetical protein  38.41 
 
 
205 aa  57.8  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.406062  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21481  hypothetical protein  38.41 
 
 
205 aa  58.2  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18051  hypothetical protein  29.2 
 
 
182 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3086  hypothetical protein  27.78 
 
 
165 aa  43.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0374593  hitchhiker  0.00021739 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4247  hypothetical protein  27.78 
 
 
183 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.397141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1196  protein of unknown function SprT  28.17 
 
 
180 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02774  hypothetical protein  27.16 
 
 
165 aa  42.4  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.110605  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0751  protein of unknown function DUF335 SprT  27.16 
 
 
165 aa  42.4  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.067857  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3102  hypothetical protein  27.16 
 
 
165 aa  42.4  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3376  hypothetical protein  27.16 
 
 
165 aa  42.4  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02737  hypothetical protein  27.16 
 
 
165 aa  42.4  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3287  hypothetical protein  27.16 
 
 
165 aa  41.2  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.717112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>