15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4477 on replicon NC_011721
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011721  PCC8801_4477    100 
 
 
1061 bp  2103    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4497  transposase IS4 family protein  99.45 
 
 
1020 bp  1066    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3382  transposase IS4 family protein  99.45 
 
 
1020 bp  1066    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3846  transposase IS4 family protein  99.45 
 
 
1020 bp  1066    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3144    99.68 
 
 
719 bp  603  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00923017  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2795    99.59 
 
 
701 bp  470  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3633  transposase IS4 family protein  85.58 
 
 
1020 bp  448  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1817    99.47 
 
 
219 bp  365  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0158    92.31 
 
 
525 bp  71.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0160  putative transposase  92.31 
 
 
231 bp  71.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0261  transposase IS4  92.68 
 
 
1023 bp  58  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3153  transposase IS4  92.68 
 
 
1023 bp  58  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0912286  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0448  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
375 bp  52  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0157    93.75 
 
 
513 bp  48.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1061    93.75 
 
 
415 bp  48.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.352914 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>