29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5843 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1206    99.22 
 
 
1358 bp  1721    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5879    100 
 
 
1084 bp  2149    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104349 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5854    100 
 
 
1084 bp  2149    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5853    100 
 
 
450 bp  892    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5845    100 
 
 
1084 bp  2149    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5844    100 
 
 
450 bp  892    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5843    100 
 
 
3090 bp  6125    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5821  hypothetical protein  100 
 
 
1084 bp  2149    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5801    100 
 
 
2650 bp  1622    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5800    100 
 
 
429 bp  848    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5765    99.11 
 
 
977 bp  1713    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5718  hypothetical protein  100 
 
 
1351 bp  1758    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5766    100 
 
 
1084 bp  2149    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5685  hypothetical protein  100 
 
 
1351 bp  1758    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5647    100 
 
 
1084 bp  2149    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0480379 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3856  putative transposase  100 
 
 
477 bp  946    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.698713 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5412    88.01 
 
 
1347 bp  482  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3857    100 
 
 
192 bp  381  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.746363 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3855  hypothetical protein  100 
 
 
2037 bp  107  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785014 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0110    81.36 
 
 
661 bp  89.7  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.456103  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2975    81.66 
 
 
716 bp  89.7  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.569025  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0273  transposase IS4  87.21 
 
 
171 bp  83.8  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2576  transposase IS4  78.41 
 
 
1320 bp  81.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1511    88.31 
 
 
743 bp  81.8  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0271821  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0282  hypothetical protein  100 
 
 
351 bp  75.8  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5815    97.37 
 
 
913 bp  67.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1150    79.88 
 
 
660 bp  65.9  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2988    97.3 
 
 
726 bp  65.9  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2368    96.97 
 
 
687 bp  58  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>