12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5448 on replicon NC_011737
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011737  PCC7424_5448    100 
 
 
1066 bp  2113    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.606109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3458    79.07 
 
 
1311 bp  157  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3462    79.07 
 
 
1311 bp  157  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5662    79.28 
 
 
2528 bp  147  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745957 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1754    78.69 
 
 
1311 bp  141  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3952  transposase IS4 family protein  80.05 
 
 
1281 bp  135  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4479  putative transposase of IS4 family insertion sequence ISY391c  79.94 
 
 
594 bp  129  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4538  FOG: transposase-like protein  79.94 
 
 
1107 bp  129  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0252  FOG: transposase-like protein  79.94 
 
 
1107 bp  129  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1782  FOG: transposase-like protein  79.94 
 
 
1107 bp  129  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4554    90.91 
 
 
1165 bp  83.8  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5050    85.96 
 
 
1260 bp  50.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>