198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0158 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0173  fructose 1,6-bisphosphatase II  98.21 
 
 
336 aa  667    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.478922  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0158  fructose 1,6-bisphosphatase II  100 
 
 
336 aa  677    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3804  fructose 1,6-bisphosphatase II  90.18 
 
 
336 aa  618  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.382741  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0107  fructose 1,6-bisphosphatase II  88.39 
 
 
336 aa  605  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4799  fructose 1,6-bisphosphatase II  87.2 
 
 
336 aa  601  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000253614 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4114  fructose 1,6-bisphosphatase II  87.8 
 
 
336 aa  594  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4048  fructose 1,6-bisphosphatase II  88.1 
 
 
336 aa  596  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0100  fructose 1,6-bisphosphatase II  87.8 
 
 
336 aa  594  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0099  fructose 1,6-bisphosphatase II  87.5 
 
 
351 aa  593  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03810  fructose 1,6-bisphosphatase II  86.31 
 
 
336 aa  589  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03759  hypothetical protein  86.31 
 
 
336 aa  589  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4365  fructose 1,6-bisphosphatase II  86.31 
 
 
336 aa  588  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.732468 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4407  fructose 1,6-bisphosphatase II  86.31 
 
 
336 aa  588  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4156  fructose 1,6-bisphosphatase II  86.31 
 
 
336 aa  588  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4459  fructose 1,6-bisphosphatase II  86.31 
 
 
336 aa  588  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4060  fructose-1,6-bisphosphatase, class II  86.31 
 
 
379 aa  587  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5380  fructose 1,6-bisphosphatase II  85.71 
 
 
336 aa  586  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4093  fructose 1,6-bisphosphatase II  86.31 
 
 
379 aa  587  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4416  fructose 1,6-bisphosphatase II  85.71 
 
 
336 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.293777  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4301  fructose 1,6-bisphosphatase II  86.01 
 
 
336 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4331  fructose 1,6-bisphosphatase II  85.71 
 
 
366 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.107152  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4484  fructose 1,6-bisphosphatase II  85.71 
 
 
336 aa  574  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4414  fructose 1,6-bisphosphatase II  85.71 
 
 
336 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2260  fructose 1,6-bisphosphatase II  78.87 
 
 
335 aa  545  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0047322  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0287  fructose 1,6-bisphosphatase II  76.19 
 
 
335 aa  530  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001754  fructose-1,6-bisphosphatase GlpX type  75.6 
 
 
335 aa  523  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000388464  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00719  fructose 1,6-bisphosphatase II  75.3 
 
 
335 aa  521  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3617  fructose 1,6-bisphosphatase II  74.4 
 
 
336 aa  512  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0291  fructose-1,6-bisphosphatase, class II  63.8 
 
 
338 aa  431  1e-119  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3072  fructose-1,6-bisphosphatase II-like protein  58.81 
 
 
321 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0231386 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02761  predicted hexoseP phosphatase  58.62 
 
 
321 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0763  fructose-1,6-bisphosphatase, class II  58.62 
 
 
321 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02724  hypothetical protein  58.62 
 
 
321 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0780  fructose-1,6-bisphosphatase II-like protein  58.62 
 
 
321 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.402469  normal  0.245947 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3088  fructose-1,6-bisphosphatase II-like protein  58.62 
 
 
321 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.939089  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3265  fructose-1,6-bisphosphatase II-like protein  58.93 
 
 
321 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.77297  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4232  fructose-1,6-bisphosphatase II-like protein  57.99 
 
 
321 aa  359  4e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3318  fructose-1,6-bisphosphatase II-like protein  57.05 
 
 
322 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.880957 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3251  fructose-1,6-bisphosphatase II-like protein  57.05 
 
 
323 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4830  fructose 1,6-bisphosphatase II  50.76 
 
 
323 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0205836  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4671  fructose 1,6-bisphosphatase II  50.76 
 
 
323 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4688  fructose 1,6-bisphosphatase II  50.76 
 
 
323 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000315487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5104  fructose 1,6-bisphosphatase II  50.76 
 
 
323 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0104372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5195  fructose 1,6-bisphosphatase II  50.76 
 
 
323 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0134  fructose 1,6-bisphosphatase II  50.76 
 
 
323 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.181933  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5066  fructose 1,6-bisphosphatase II  50.76 
 
 
323 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5105  fructose 1,6-bisphosphatase II  50.76 
 
 
323 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.896265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5099  fructose 1,6-bisphosphatase II  50.46 
 
 
323 aa  318  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4783  fructose 1,6-bisphosphatase II  50.46 
 
 
323 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5182  fructose 1,6-bisphosphatase II  47.56 
 
 
321 aa  315  5e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5017  fructose 1,6-bisphosphatase II  47.56 
 
 
321 aa  315  5e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000418488  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5033  fructose 1,6-bisphosphatase II  47.56 
 
 
321 aa  315  5e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.518468  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5576  fructose 1,6-bisphosphatase II  47.56 
 
 
321 aa  315  5e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000266244  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5131  fructose 1,6-bisphosphatase II  47.56 
 
 
321 aa  315  5e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0267137  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3560  fructose 1,6-bisphosphatase II  50.46 
 
 
323 aa  315  6e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3854  fructose 1,6-bisphosphatase II  47.56 
 
 
321 aa  315  8e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000181718  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5462  fructose 1,6-bisphosphatase II  47.26 
 
 
321 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174828  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2409  fructose 1,6-bisphosphatase II  49.39 
 
 
328 aa  314  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00278176  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5456  fructose 1,6-bisphosphatase II  47.26 
 
 
321 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000446335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5496  fructose 1,6-bisphosphatase II  47.26 
 
 
321 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484308  unclonable  7.90182e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5511  fructose 1,6-bisphosphatase II  46.95 
 
 
321 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000902991  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1352  fructose 1,6-bisphosphatase II  48.96 
 
 
322 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000170058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3440  fructose 1,6-bisphosphatase II  48.32 
 
 
320 aa  309  4e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2876  fructose 1,6-bisphosphatase II  49.55 
 
 
323 aa  305  5.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000450051  hitchhiker  0.000000285517 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3330  fructose 1,6-bisphosphatase II  47.4 
 
 
320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0599987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4837  fructose 1,6-bisphosphatase II  48.48 
 
 
330 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374788  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1640  fructose 1,6-bisphosphatase II  49.54 
 
 
321 aa  298  8e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2220  fructose 1,6-bisphosphatase II  48.63 
 
 
321 aa  295  6e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.742385  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1013  fructose-1,6-bisphosphatase, class II  47.58 
 
 
328 aa  295  6e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2308  fructose 1,6-bisphosphatase II  48.33 
 
 
321 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1609  fructose 1,6-bisphosphatase II  49.23 
 
 
321 aa  291  1e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.342768  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1793  fructose 1,6-bisphosphatase II  45.99 
 
 
331 aa  289  6e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0102519  normal  0.140002 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2503  fructose 1,6-bisphosphatase II  48.17 
 
 
341 aa  288  7e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.208144 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0850  fructose 1,6-bisphosphatase II  46.63 
 
 
327 aa  287  2e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0442913  normal  0.113278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8487  Fructose-bisphosphatase  47.53 
 
 
344 aa  287  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.177267  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31520  fructose 1,6-bisphosphatase II  47.42 
 
 
350 aa  287  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0903964  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2252  fructose-1,6-bisphosphatase, class II  48.5 
 
 
333 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108614  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0653  fructose 1,6-bisphosphatase II  44.34 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0143338 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1866  fructose 1,6-bisphosphatase II  46.01 
 
 
326 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05200  fructose 1,6-bisphosphatase II  45.76 
 
 
340 aa  281  1e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.205575  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2171  fructose 1,6-bisphosphatase II  48.48 
 
 
321 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1592  fructose 1,6-bisphosphatase II  42.94 
 
 
327 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0753  fructose 1,6-bisphosphatase II  43.87 
 
 
327 aa  280  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.201188  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0724  fructose 1,6-bisphosphatase II  46.46 
 
 
350 aa  279  5e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.66384  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2334  fructose 1,6-bisphosphatase II  47.27 
 
 
319 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.01409e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3119  fructose-1,6-bisphosphatase, class II  44.48 
 
 
340 aa  277  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0340189  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20440  fructose 1,6-bisphosphatase II  46.32 
 
 
328 aa  277  2e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.51035  normal  0.537147 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12700  fructose 1,6-bisphosphatase II  47.48 
 
 
326 aa  277  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3378  fructose 1,6-bisphosphatase II  44.65 
 
 
328 aa  277  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0533542  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1066  fructose 1,6-bisphosphatase II  45.43 
 
 
339 aa  275  8e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0464  fructose 1,6-bisphosphatase II  47.06 
 
 
341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.932299  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3256  hypothetical protein  45.23 
 
 
329 aa  273  3e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.552771  normal  0.220961 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0866  fructose 1,6-bisphosphatase II  43.16 
 
 
338 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1119  fructose 1,6-bisphosphatase II  45.09 
 
 
346 aa  273  4.0000000000000004e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.614977  normal  0.855236 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1877  fructose 1,6-bisphosphatase II  46.01 
 
 
349 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.878779  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1876  fructose 1,6-bisphosphatase II  46.58 
 
 
334 aa  271  9e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01960  fructose 1,6-bisphosphatase II  46.59 
 
 
330 aa  271  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8277  fructose 1,6-bisphosphatase II  44.17 
 
 
343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.048126  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0188  fructose 1,6-bisphosphatase II  43.25 
 
 
327 aa  270  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00461143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1134  fructose-1,6-bisphosphatase class II  44.94 
 
 
332 aa  268  7e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0515982 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>