More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_r0653 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_r0409  16S ribosomal RNA  84.55 
 
 
1550 bp  809    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0168  16S ribosomal RNA  84.55 
 
 
1550 bp  809    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SA  16S ribosomal RNA  84.13 
 
 
1551 bp  860    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SB  16S ribosomal RNA  84.13 
 
 
1551 bp  860    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SC  16S ribosomal RNA  84.13 
 
 
1551 bp  860    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SD  16S ribosomal RNA  84.13 
 
 
1551 bp  860    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SE  16S ribosomal RNA  84.13 
 
 
1551 bp  860    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SF  16S ribosomal RNA  84.13 
 
 
1551 bp  860    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SG  16S ribosomal RNA  84.13 
 
 
1551 bp  860    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_r1373  16S ribosomal RNA  100 
 
 
1567 bp  3106    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0881633  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_r0653  16S ribosomal RNA  100 
 
 
1567 bp  3106    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0994186  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2572  16S ribosomal RNA  85.16 
 
 
1548 bp  821    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2494  16S ribosomal RNA  85.16 
 
 
1548 bp  821    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2609  16S ribosomal RNA  85.16 
 
 
1548 bp  821    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0181  16S ribosomal RNA  84.55 
 
 
1550 bp  809    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0163  16S ribosomal RNA  88.24 
 
 
1549 bp  1289    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0633257  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0019  16S ribosomal RNA  88.24 
 
 
1549 bp  1289    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.163804  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1835  16S ribosomal RNA  88.24 
 
 
1549 bp  1289    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.364981  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1708  16S ribosomal RNA  88.24 
 
 
1549 bp  1289    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0019  16S ribosomal RNA  84.55 
 
 
1550 bp  809    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2179  16S ribosomal RNA  85.16 
 
 
1548 bp  821    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r0552  16S ribosomal RNA  85.16 
 
 
1548 bp  821    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0079  16S ribosomal RNA  84.55 
 
 
1550 bp  809    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.940903  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r1784  16S ribosomal RNA  84.46 
 
 
1550 bp  801    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2451  16S ribosomal RNA  85.16 
 
 
1548 bp  821    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.892819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5722  16S ribosomal RNA  85.34 
 
 
1509 bp  599  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0170559  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0341  16S ribosomal RNA  85.34 
 
 
1509 bp  599  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-4  16S ribosomal RNA  85.34 
 
 
1510 bp  599  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.823998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_10  16S ribosomal RNA  85.34 
 
 
1510 bp  599  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_13  16S ribosomal RNA  85.34 
 
 
1503 bp  599  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.529698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_3  16S ribosomal RNA  85.34 
 
 
1503 bp  599  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SD  16S ribosomal RNA  85.34 
 
 
1507 bp  599  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.532325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0595  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1508 bp  591  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0031  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1508 bp  591  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000247217  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0324  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1508 bp  591  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000098756  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0184  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1508 bp  591  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000878132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0330  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1508 bp  591  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00177691  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5738  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1508 bp  591  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5741  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1508 bp  591  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5744  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1508 bp  591  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5747  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1509 bp  591  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5750  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1508 bp  591  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181478  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5753  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1509 bp  591  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5756  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1508 bp  591  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5759  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1509 bp  591  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5762  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1509 bp  591  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5765  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1508 bp  591  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0443196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5768  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1508 bp  591  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.642383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5771  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1562 bp  591  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000116476  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0064  16S ribosomal RNA  90.02 
 
 
1587 bp  591  1e-166  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000848951  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0091  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1508 bp  591  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.263967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-1  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1510 bp  591  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-10  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1510 bp  591  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0104  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1508 bp  591  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000984323  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-2  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1510 bp  591  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-3  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1510 bp  591  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-5  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1510 bp  591  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.528654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-6  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1510 bp  591  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0139984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-7  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1510 bp  591  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-8  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1510 bp  591  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-9  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1509 bp  591  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.375942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_r01  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1555 bp  591  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_1  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1510 bp  591  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_11  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1510 bp  591  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_12  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1510 bp  591  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_13  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1510 bp  591  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_2  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1510 bp  591  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_3  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1510 bp  591  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_4  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1510 bp  591  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_5  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1509 bp  591  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_6  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1510 bp  591  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.457482  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_7  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1510 bp  591  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_8  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1510 bp  591  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_9  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1509 bp  591  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_1  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1510 bp  591  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.218805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_10  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1510 bp  591  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_11  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1503 bp  591  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_12  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1510 bp  591  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.379759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_2  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1510 bp  591  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0475549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_4  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1503 bp  591  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.847073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_5  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1510 bp  591  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_6  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1510 bp  591  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_7  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1510 bp  591  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.153942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_8  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1510 bp  591  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_9  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1510 bp  591  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.248358  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0046  16S ribosomal RNA  90.02 
 
 
1587 bp  591  1e-166  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000560958  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0022  16S ribosomal RNA  90.02 
 
 
1587 bp  591  1e-166  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107044  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0009  16S ribosomal RNA  90.02 
 
 
1587 bp  591  1e-166  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000146343  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0356  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1509 bp  591  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0079994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SA  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1507 bp  591  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0223129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SB  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1507 bp  591  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00333572  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SC  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1507 bp  591  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SE  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1507 bp  591  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000292428  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SF  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1507 bp  591  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SG  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1507 bp  591  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SH  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1507 bp  591  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SI  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1506 bp  591  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000329338  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SJ  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1507 bp  591  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0347  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1509 bp  591  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0567858  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0007  16S ribosomal RNA  85.21 
 
 
1509 bp  591  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>