14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0531 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0531  hypothetical protein  100 
 
 
376 aa  730    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.994016  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0385  hypothetical protein  26.81 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.354879  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2673  putative peptidase  32.85 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0577638  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0726  putative peptidase  29.65 
 
 
225 aa  64.3  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0342  Ste24 endopeptidase  26.67 
 
 
418 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2347  Ste24 endopeptidase  22.61 
 
 
410 aa  51.2  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441735 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0713  Ste24 endopeptidase  24.88 
 
 
418 aa  49.7  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.442824  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0538  M48 family peptidase  26.33 
 
 
453 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0359  Ste24 endopeptidase  24.38 
 
 
406 aa  47.4  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1469  Ste24 endopeptidase  23.34 
 
 
429 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.365872  normal  0.600215 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2454  Ste24 endopeptidase  24.28 
 
 
414 aa  44.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1431  Ste24 endopeptidase  22.59 
 
 
404 aa  43.5  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00867901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0109  peptidase M48, Ste24p  23.96 
 
 
421 aa  43.5  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000135832  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0572  Ste24 endopeptidase  22.88 
 
 
389 aa  42.7  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.209932 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>