13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4554 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4554  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  176  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0440351  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2734  addiction module killer protein  50 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4242  addiction module killer protein  59.09 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0684  hypothetical protein  53.19 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00337855  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6456  addiction module killer protein  56.82 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4612  addiction module killer protein  56.82 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4762  addiction module killer protein  54.55 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.621816  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0084  hypothetical protein  53.33 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.033356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1245  addiction module killer protein  50 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0185  hypothetical protein  44.44 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.431442  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2122  addiction module killer protein  59.38 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.434531  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3915  hypothetical protein  62.07 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5374  hypothetical protein  36.21 
 
 		 107 aa  40.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000336277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>