13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4090 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4090  hypothetical protein  100 
 
 		 50 aa  103  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3958  hypothetical protein  80 
 
 		 50 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.5126  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3655  hypothetical protein  80 
 
 		 50 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04856  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1259  hypothetical protein  70 
 
 		 50 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0994  hypothetical protein  66 
 
 		 50 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.987694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1786  hypothetical protein  53.06 
 
 		 79 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1197  hypothetical protein  76 
 
 		 50 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1226  hypothetical protein  56 
 
 		 50 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3969  aa3 type cytochrome c oxidase subunit IV  48 
 
 		 50 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.341664  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4663  aa3 type cytochrome c oxidase subunit IV  42 
 
 		 50 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1434  aa3 type cytochrome c oxidase subunit IV  42 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1414  aa3 type cytochrome c oxidase subunit IV  42 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6859  hypothetical protein  46.15 
 
 		 50 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.287018 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>