11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3815 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3815  hypothetical protein  100 
 
 		 60 aa  120  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1039  hypothetical protein  50.85 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4205  hypothetical protein  50.82 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.85607  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1068  hypothetical protein  45 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3848  hypothetical protein  46.43 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.74444  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2471  hypothetical protein  42.86 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3010  hypothetical protein  44.26 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4097  hypothetical protein  42.59 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2409  hypothetical protein  47.27 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0014306  normal  0.0229903 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3932  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1204  hypothetical protein  36.67 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>