9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3476 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3476  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  272  9e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0714  hypothetical protein  58.52 
 
 		 101 aa  100  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5224  hypothetical protein  47.37 
 
 		 93 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0828  hypothetical protein  55.13 
 
 		 83 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0937  hypothetical protein  50 
 
 		 83 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1146  hypothetical protein  53.85 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0371  hypothetical protein  63.46 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.650544 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4874  hypothetical protein  51.52 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1539  hypothetical protein  72 
 
 		 282 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>