15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0791 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0791  hypothetical protein  100 
 
 
522 aa  1066    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.43296  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2349  xanthosine triphosphate pyrophosphatase-like protein  92.65 
 
 
531 aa  973    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.748683  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3143  hypothetical protein  26.82 
 
 
383 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0414746  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2012  adenylate kinase related protein (AdkA-like)  24.72 
 
 
188 aa  60.5  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.763015  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0694  dephospho-CoA kinase  26.71 
 
 
196 aa  53.9  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.202275  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1593  hypothetical protein  22.83 
 
 
182 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0813  hypothetical protein  22.22 
 
 
188 aa  50.1  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00430101  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1363  hypothetical protein  27.91 
 
 
179 aa  48.9  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000000906379  hitchhiker  0.0000000219103 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0311  hypothetical protein  22.47 
 
 
183 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.677562  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1975  hypothetical protein  24.31 
 
 
182 aa  46.6  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.471384 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1714  hypothetical protein  31.36 
 
 
173 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.992026  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2153  hypothetical protein  25 
 
 
171 aa  45.8  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000173574  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0592  hypothetical protein  22.47 
 
 
185 aa  45.1  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1229  putative deoxyribonucleotide triphosphate pyrophosphatase  27.27 
 
 
186 aa  45.4  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1392  hypothetical protein  28.16 
 
 
183 aa  43.9  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>