22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5178 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5178  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2238  hypothetical protein  62.92 
 
 
199 aa  218  5e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292419  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1151  hypothetical protein  51.67 
 
 
203 aa  175  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12032  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0862  hypothetical protein  46.8 
 
 
210 aa  169  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.968842 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0705  hypothetical protein  36.71 
 
 
211 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.491097  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0121  hypothetical protein  41.61 
 
 
208 aa  123  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12616  hypothetical protein  39.8 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.201199  normal  0.554674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8433  hypothetical protein  34.55 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652599  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1866  hypothetical protein  38.27 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1886  hypothetical protein  37.76 
 
 
196 aa  111  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.222314  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1932  hypothetical protein  37.76 
 
 
196 aa  111  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3026  hypothetical protein  38.56 
 
 
216 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124096  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0312  hypothetical protein  26.82 
 
 
168 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4698  hypothetical protein  26.26 
 
 
168 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4923  hypothetical protein  26.26 
 
 
168 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5059  hypothetical protein  26.26 
 
 
168 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.707002  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4942  hypothetical protein  26.26 
 
 
168 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4555  group-specific protein  26.26 
 
 
168 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4959  hypothetical protein  26.26 
 
 
168 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4637  hypothetical protein  25.7 
 
 
168 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4538  hypothetical protein  26.26 
 
 
168 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4927  hypothetical protein  26.26 
 
 
168 aa  42  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>