11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_R0013 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_R0013  tRNA-Asp  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0031  tRNA-Asp  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.998117 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0030  tRNA-Asp  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00775153  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00620  tRNA-Glu  100 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06450  tRNA-Glu  100 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.990683  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04820  tRNA-Glu  100 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.59741  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0049  tRNA-Asp  86.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000227273  decreased coverage  0.00000000261131 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0050  tRNA-Asp  86.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000210067  decreased coverage  0.00000000256467 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0021  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.905442  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0055  tRNA-Asp  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0015  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00401189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>