13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_R0050 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_R0050  tRNA-Pro  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.33175  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0019  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  127  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.619417  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0014  tRNA-Pro  95.77 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.19833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0023  tRNA-Pro  96.61 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.780382  normal  0.0887922 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0028  tRNA-OTHER  96.61 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.689553  normal  0.302878 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0039  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.828946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0045  tRNA-OTHER  92.06 
 
 		 78 bp  85.7  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.088797  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0032  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000752969  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0010  tRNA-OTHER  89.66 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0060  tRNA-Pro  87.93 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00280005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0035  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.420801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0038  tRNA-Pro  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0044  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>