24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3793 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3793  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.528629  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3797  hypothetical protein  99.58 
 
 
236 aa  467  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.489378  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3866  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00343501  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1252  hypothetical protein  46.55 
 
 
241 aa  183  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000989157 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0817  hypothetical protein  43.04 
 
 
234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4573  hypothetical protein  39.82 
 
 
245 aa  170  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.394027 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1812  hypothetical protein  31.53 
 
 
251 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.990296  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4933  hypothetical protein  30.59 
 
 
274 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160157  normal  0.0191382 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4464  hypothetical protein  33.33 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.564431  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4758  hypothetical protein  33.33 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0859856  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4377  hypothetical protein  33.33 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158448  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1251  hypothetical protein  26.77 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116515 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0910  hypothetical protein  27.27 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0997  hypothetical protein  27.27 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810526  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2236  hypothetical protein  27.27 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0076  hypothetical protein  26.77 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219876  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1542  hypothetical protein  26.77 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1164  hypothetical protein  26.77 
 
 
230 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.508212  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4574  hypothetical protein  24.89 
 
 
266 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.269473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0818  hypothetical protein  23.11 
 
 
268 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3796  hypothetical protein  28.3 
 
 
273 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.524108  normal  0.454726 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3865  hypothetical protein  28.3 
 
 
273 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00529011  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3792  hypothetical protein  28.3 
 
 
273 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.154004  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3573  hypothetical protein  23.08 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>