15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_R0009 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_R0009  tRNA-Gly  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.486224  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0008  tRNA-Gly  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0005  tRNA-Gly  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0046  tRNA-Gly  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0011  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0243841  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0011  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 95 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0026  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 97 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0037  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 97 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0025  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0028  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0032  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.998395  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0005  tRNA-Phe  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0024  tRNA-Phe  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0014  tRNA-Phe  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0656754 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0040  tRNA-Phe  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.738588 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>