14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0878 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0878  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  217  5e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.278673  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0186  hypothetical protein  94.29 
 
 
105 aa  209  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1725  hypothetical protein  93.33 
 
 
105 aa  205  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.912096 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1576  hypothetical protein  78.1 
 
 
105 aa  168  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121552  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0880  hypothetical protein  56.64 
 
 
113 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0033  hypothetical protein  52.56 
 
 
94 aa  84  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.686342 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2093  hypothetical protein  43.59 
 
 
93 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0864  hypothetical protein  34.65 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1909  hypothetical protein  41.03 
 
 
92 aa  67  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2574  hypothetical protein  40.51 
 
 
90 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0222  hypothetical protein  43.59 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0244  hypothetical protein  37 
 
 
102 aa  62.4  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1978  hypothetical protein  39.13 
 
 
92 aa  60.1  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0052477  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0866  hypothetical protein  38.46 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>