26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5400 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5420  Tn554 transposase C  100 
 
 
144 aa  288  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5400  Tn554 transposase C  100 
 
 
144 aa  288  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.322304 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1428  hypothetical protein  49.26 
 
 
143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.842918 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3742  hypothetical protein  32.71 
 
 
151 aa  51.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.165817  normal  0.166782 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3700  hypothetical protein  32.71 
 
 
151 aa  51.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.0757476 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3605  hypothetical protein  32.71 
 
 
151 aa  51.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438159  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3587  hypothetical protein  32.71 
 
 
151 aa  51.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00101859  hitchhiker  0.00420892 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3467  hypothetical protein  32.71 
 
 
151 aa  51.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000714931  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3042  hypothetical protein  32.71 
 
 
151 aa  51.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000211872  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1217  hypothetical protein  32.71 
 
 
151 aa  51.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.471873  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20680  hypothetical protein  28.33 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5579  Tn554 transposase C  32.5 
 
 
136 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.142757  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5982  Tn554 transposase C  32.5 
 
 
136 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100024 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1706  Tn554 transposase C  32.5 
 
 
136 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.428183  normal  0.726116 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0041  hypothetical protein  26.98 
 
 
125 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1749  transposase C  26.98 
 
 
125 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0515142  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0041  transposase C  26.98 
 
 
125 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1715  hypothetical protein  26.98 
 
 
125 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1222  Tn554, transposase C  26.98 
 
 
125 aa  47  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.406172  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2508  transposase C  26.98 
 
 
125 aa  47  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1345  Tn554, transposase C  26.98 
 
 
125 aa  47  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.48527  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06610  hypothetical protein  26.67 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0352144  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5933  Tn554-related, transposase C  33.02 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3902  Tn554-related, transposase C  33.02 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3898  Tn554-related, transposase C  33.02 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.768404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0480  Tn554-related, transposase C  33.02 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170868  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>