15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3260 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3260  protein CoxF  100 
 
 		 54 aa  103  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0873642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3584  protein CoxF  100 
 
 		 54 aa  103  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3456  conserved protein CoxF  90.74 
 
 		 54 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0263  protein CoxF  70.37 
 
 		 50 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120067  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0030  protein CoxF  68.52 
 
 		 54 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148285  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0727  protein CoxF  50.94 
 
 		 55 aa  57.4  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2346  protein CoxF  72.22 
 
 		 50 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0226  CoxF protein  53.7 
 
 		 56 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0764  CoxF protein  53.7 
 
 		 56 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4790  putative CoxF  54.55 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0672  hypothetical protein  43.33 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482572 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0902  CoxF protein  52 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0674992  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0258  CoxF protein  52.27 
 
 		 54 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.962663  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3460  CoxF protein  52.27 
 
 		 54 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548506  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0605  hypothetical protein  42.11 
 
 		 46 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>