18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1881 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1881  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 
96 aa  199  9e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2244  hypothetical protein  41.84 
 
 
99 aa  81.6  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.934041  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2116  hypothetical protein  37.89 
 
 
99 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016829  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1911  hypothetical protein  37.23 
 
 
99 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.309436  hitchhiker  0.00132247 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2169  type IV pilus assembly PilZ  38.38 
 
 
100 aa  62.8  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27930  hypothetical protein  37.63 
 
 
99 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2358  hypothetical protein  36.56 
 
 
99 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1928  type IV pilus assembly PilZ  33.68 
 
 
99 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2164  type IV pilus assembly PilZ  34.25 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0370021  normal  0.992287 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0072  type IV pilus assembly PilZ  32.95 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1284  type IV pilus assembly PilZ  38.3 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.825069  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02393  membrane protein-like protein  37.7 
 
 
66 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432482  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1681  type IV pilus assembly PilZ  35.14 
 
 
99 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936113  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1111  hypothetical protein  35.71 
 
 
106 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3578  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 
99 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00410027  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1705  type IV pilus assembly PilZ  34.25 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105671 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0636  type IV pilus assembly PilZ  24.18 
 
 
201 aa  43.9  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0075544 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2226  type IV pilus assembly PilZ  32.05 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>