11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01968 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01968  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  351  2.9999999999999997e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01154  hypothetical protein  97.45 
 
 
193 aa  322  2e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02532  hypothetical protein  93.49 
 
 
177 aa  321  4e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01165  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  320  8e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381833  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02808  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  319  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01016  hypothetical protein  99.26 
 
 
167 aa  282  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000451344  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00455  hypothetical protein  80.95 
 
 
65 aa  111  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.264449  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02624  hypothetical protein  75.76 
 
 
80 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.904169  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02785  hypothetical protein  79.69 
 
 
68 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.689454  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00417  hypothetical protein  78.46 
 
 
75 aa  108  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00702  hypothetical protein  96 
 
 
52 aa  107  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0690436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>