15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4289 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4289  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  232  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1763  hypothetical protein  49.49 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20550  hypothetical protein  49.49 
 
 		 112 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000591762  normal  0.454252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3518  hypothetical protein  52.38 
 
 		 111 aa  87  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403763  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2794  hypothetical protein  53.7 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120676  normal  0.0933812 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2907  hypothetical protein  46.3 
 
 		 384 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.54466 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1754  hypothetical protein  56.86 
 
 		 57 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000409151 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2025  hypothetical protein  56.86 
 
 		 57 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000266381 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01375  hypothetical protein  69.23 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2227  conserved hypothetical protein  69.23 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0435243  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1501  hypothetical protein  69.23 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1599  hypothetical protein  69.23 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2240  hypothetical protein  69.23 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1643  hypothetical protein  69.23 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.84144  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01387  hypothetical protein  69.23 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>