15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0647 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0647  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  313  9e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1807  hypothetical protein  55.24 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.736009  hitchhiker  0.00000000084544 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0864  hypothetical protein  50.68 
 
 		 172 aa  137  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1983  hypothetical protein  48.97 
 
 		 170 aa  133  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0234  hypothetical protein  45.39 
 
 		 177 aa  107  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1817  hypothetical protein  40.59 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000441107  hitchhiker  0.0000000000273525 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0818  hypothetical protein  34.96 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3272  hypothetical protein  35.19 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0241  hypothetical protein  35.79 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2722  hypothetical protein  32.48 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000000000717542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0152  hypothetical protein  29.81 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000476371  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0745  hypothetical protein  37.89 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2610  hypothetical protein  27.78 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0007  hypothetical protein  35.37 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3386  hypothetical protein  28 
 
 		 155 aa  44.7  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>